O BioBlender é um pacote de software criado no software de modelagem 3D de código aberto.A biologia trabalha em nanoescala, com objetos invisíveis ao olho humano.Com o BioBlender, é possível mostrar alguns dos caracteres que povoam nossas células, com base em dados científicos e no mais alto padrão de manipulação 3D.Cientistas de todo o mundo estudam proteínas em nível atômico e depositam informações no repositório público Protein Data Bank, onde cada molécula é descrita como a lista de seus átomos e suas coordenadas 3D. Com o BioBlender, os usuários podem manipular proteínas no espaço 3D., exibindo sua superfície de maneira fotorrealista e elaborando movimentos de proteínas com base em conformações conhecidas.Os arquivos PDB podem ser carregados de um diretório definido pelo usuário ou baixados diretamente do site do PDB (inserindo o código do PDB).A proteína é exibida em 3D (como átomos ou superfície molecular) e o usuário pode calcular e visualizar suas propriedades de superfície, potencial lipofílico molecular e potencial eletrostático.Para o movimento da proteína, o BioBlender calcula intermediários entre duas conformações usando o Blender Game Engine.O programa fornece como saída os arquivos PDB intermediários e as imagens renderizadas como um filme.O BioBlender é uma implementação do Blender, um programa de código aberto, de distribuição livre, multiplataforma, interoperável e suportado de animação 3D, efeitos visuais e videogames.A combinação de computação gráfica em 3D, mecanismo de jogo e programas científicos, fazem do BioBlender um instrumento completo para elaborar o movimento de proteínas e exibir suas características de superfície usando um código visual baseado em texturas e efeitos especiais de partículas.Desta forma, é possível mostrar as propriedades físicas e químicas de uma molécula em movimento.O BioBlender é o resultado de uma colaboração, conduzida pelo grupo SciVis no CNR em Pisa (Itália), entre cientistas de diferentes disciplinas (biologia, química, física, ciências da computação) e