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DNAssist
O DNAssist fornece uma interface única e intuitiva, na qual os arquivos de seqüência são exibidos, editados e analisados.O usuário pode personalizar a exibição nas janelas do editor, selecionando a fonte, o tamanho da fonte e o comprimento da linha.Uma sequência é analisada simplesmente trazendo uma janela do editor para o topo e selecionando a análise necessária no menu.Todas as análises também podem ser realizadas em uma região selecionada da sequência em uma janela do editor.Clicar com o botão direito do mouse fornecerá um menu pop-up sensível ao contexto.Isso fornece ao usuário um atalho conveniente para a maioria dos itens de menu.As análises disponíveis no DNAssist incluem: A conversão de uma sequência de DNA entre as formas circular e linear A conversão de DNA em um RNA ou uma sequência de proteínas A conversão de RNA em um DNA ou uma sequência de proteínas Traduzindo uma sequência de DNA para a sequência de aminoácidosem um, três ou todos os seis quadros Localizando quadros de leitura abertos (ORFs) em uma sequência de DNA Localizando padrões de sequência específicos em uma sequência (isso permite caracteres curinga, incompatibilidades e lacunas) Executando uma análise enzimática de restrição com um conjunto definido de enzimas Executando um promotor de DNAanálise com fatores de transcrição especificados Localização de sinais fortes de posicionamento de nucleossomos no DNA Realização de múltiplos alinhamentos de DNA, RNA ou proteínas Obtenção do peso molecular de um ácido nucleico ou proteína Obtenção da temperatura de fusão de um oligonucleotídeo Cálculo do pI de uma proteína Cálculo do pI de uma proteína Cálculo do hidrofílico, hidrofóbico ouperfil antigênico de uma proteína Obtenção do coeficiente de absorção molar e de E0,1% de uma proteínad ou uma proteína A obtenção da composição de nucleotídeo ou aminoácido de um DNAssist de ácido nucleico ou proteína reúne todos esses recursos em um aplicativo Windows totalmente integrado.O resultado de uma análise é exibido em uma janela de resultados e pode ser impresso, salvo em disco ou copiado e colado em aplicativos de terceiros.Os resultados salvos ou copiados mantêm o formato em que foram exibidos.
Local na rede Internet:
https://github.com/mcychan/DNAssist/wikiCategorias
Alternativas ao DNAssist para Web com licença gratuita
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Genome Compiler
O Genome Compiler é uma plataforma de design genético fácil de usar, que permite aos pesquisadores manipular e projetar tudo, de genes únicos a genomas inteiros.