DbDesigner.net

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O DbDesigner é um aplicativo da web que permite projetar o esquema do banco de dados sem escrever SQL.
Você pode projetar o esquema do banco de dados da mesma forma que cria um diagrama UML.Quando você terminar, poderá gerar um script SQL para os seguintes mecanismos de banco de dados: PostgreSQL SQLite MySQL ™ MSSql ™ Oracle®
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Alternativas ao DbDesigner.net para todas as plataformas com qualquer licença

SQLeo Visual Query Builder

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Uma poderosa ferramenta SQL para transformar ou reverter consultas complexas (geradas pelo OBIEE, Microstrategy, Cognos, Hyperion, Pentaho ...) em diagramas para facilitar a visualização e análise.
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Emma

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Emma é um kit de ferramentas gráficas para desenvolvedores e administradores de banco de dados MySQL.Ele fornece diálogos para criar ou modificar bancos de dados MySQL, tabelas e índices associados.
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O Laravel Database Designer é uma ferramenta gráfica de migração para a criação de esquema de banco de dados para o Laravel 4 PHP Framework.
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O Percona Toolkit é uma coleção de ferramentas avançadas de linha de comando de código aberto, para executar uma variedade de tarefas do MySQL®, MongoDB® e de sistema que são muito difíceis ou complexas para serem executadas manualmente.Antes de ser adquirida pela Percona, era conhecida como Maatkit.
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Crie modelos de dados lógicos e físicos, compare e modifique scripts e faça a engenharia reversa e avançada dos bancos de dados e sistemas de armazém.Implantação rápida de várias plataformas em mais de 20 plataformas diferentes.
WWW SQL Designer

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Essa ferramenta permite desenhar e criar esquemas de banco de dados (diagramas de ER) diretamente no navegador, sem a necessidade de programas externos (flash).Você só precisa do JavaScript ativado.
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O Visual Alchemist é uma ferramenta de diagramação e automação de banco de dados de código aberto baseada na Web.
Advanced Resource Management System

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Sistema de gerenciamento baseado na Web para MYSQL.Gerencie com segurança vários servidores MySQL a partir de um local da Web: GUI baseada em AJAX.
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O myLittleAdmin é a primeira ferramenta de gerenciamento baseada na Web, especialmente projetada para o MS SQL Server.
dbForge Studio for MySQL

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O dbForge Studio for MySQL é o cliente universal MySQL e MariaDB para gerenciamento, administração e desenvolvimento de banco de dados.Com a ajuda deste cliente MySQL inteligente, o trabalho com dados e código se tornou mais fácil e conveniente.